Sterilizasyon mekanları tek oda veya iki oda şekline olabilir. Büyük tedavi merkezlerinde kullanılan iki odalı tasarımlarda “kirli alan” ile “temiz alan” birbirlerinden ayrılmıştır. Hatta bazı birimlerde “yarı steril alan” ve “steril alan” gibi çok daha detaylandırılmış bölümler bulunur.