Magnezyum sitrat en iyi aç karnına çalışır, ve her zaman ardından tam bir bardak (25 cl) su veya meyvesuyu içilmelidir , böylece magnezyum sitrat tam olarak emilebilir ve komplikasyonlar engellenir. Magnezyum sitrat çözeltileri genellikle bir ile üç buçuk saat içinde bağırsak hareketi sağlar.