Dezenfektan hazırlandıktan sonra endoskopların tüm çıkarılan parçaları ayrılarak dezenfektan içine konulmalıdır. Endoskoplar kuru olarak dezenfektana konulmalıdır. 1.2.2.2. Dezenfektan endoskopun tüm kanallarından geçirilmeli bu işlem en az 12 defa tekrarlanmalıdır.