Alanın veya kişinin bu mikroorganizmalarla teması, bulaşma ve kirlenmeye sebep olur, buna kontaminasyon adı verilir. Bu bölgelerin ya da kişilerin dezenfeksiyon gibi işlemlerle zararsız duruma getirilmesi, enfeksiyon etkeni mikroorganizmalardan arındırılması işlemine de dekontaminasyon denir.