En temel farklılık, bilgisayar mühendisliği hem yazılım işleriyle, hem donanım işleriyle ilgilenirken; yazılım mühendisliği genel anlamda yazılım odaklı çalışmalar yürütür. Yazılım mühendisliği uzmanlık ve iş büyümesinde daha avantajlı görünmektedir.