İki ya da daha fazla atom birbirleri ile kimyasal bağ yaparlarsa molekülleri oluştururlar. Atomların aynı ya da birbirinden farklı olmasının bir önemi yok. İki ya da daha fazla elementten oluşan moleküller , bileşik olarak adlandırılır. Su, kalsiyum oksit ve glukoz; bileşik olan moleküllerdir.